Ensenada, Baja California, México, 23 de agosto de 2017, México Ambiental.- El Centro de Investigación Científica y de Educación Superior (CICESE) de Ensenada, realizará su cuarto Taller de Bioinformática Análisis de metagoenomas y metatrabscriptomas ambientales del 25 al 29 de septiembre en esta institución.
El objetivo es aprender los fundamentos y el uso de diferentes programas que permiten caracterizar la estructura y función de las comunidades microbianas ambientales.
De acuerdo al CICESE, la secuenciación masiva paralelizada se ha generalizado como una herramienta que nos brinda la posibilidad de realizar estudios ambientales de manera muy exhaustiva, permitiéndonos descubrir y describir las complejas comunidades que los microorganismos forman, sin necesidad de cultivarlos.
La metagenómica no dirigida (metagenómica shotgun) y la metatranscriptómica, es decir, la secuenciación completa del material genético (ADN y ARN) obtenido directamente del medio permiten evaluar la diversidad genética y el potencial funcional de estos organismos, eliminando, al mismo tiempo, la necesidad de aislarlos.
La gran cantidad de información generada por las plataformas de secuenciación de última generación ha impulsado un sano debate sobre las mejores prácticas para el análisis de datos, al mismo tiempo que incrementa la demanda de nuevas herramientas que ayuden a abordar e interpretar importantes cuestiones ecológicas.
Con este taller se pretende dar una visión reciente de las técnicas y programas más usados en el análisis de datos metagenómicos, aprendiendo estrategias de obtención y organización de los datos procedentes de secuenciación masiva, los principios básicos para el análisis de calidad de las secuencias, métodos de asignación taxonómica y agrupamiento de genes, ensamblado, clasificación y caracterización funcional, modelos estadísticos para la estimación de la diversidad microbiana y la metodología y métricas que nos permitan comparar las comunidades microbianas.
El taller está dirigido a estudiantes de posgrado, investigadores y personas interesadas. Los aspirantes deben tener conocimientos básicos en herramientas de bioinformática y de biología molecular y domino básico del idioma inglés.
Mayores informes: CICESE, Carretera Ensenada-Tijuana No. 3918, Zona Playitas, CP 22860, Ensenada, Baja California, México. Teléfono: 01(646)175-05-00 ext. 27163.
